高速塩基配列検索ソフトウェア GGGenome(ゲゲゲノム)※1パッケージ版 創薬基本パックに新たにラットのD3Gデータベースを追加し、さらに検索機能や利便性が向上した2022年版を6月13日より提供開始します。

■GGGenomeパッケージ版 創薬基本パック2022年版

GGGenomeパッケージ版は、大学共同利用機関法人情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター（以下DBCLS）の提供するGGGenomeウェブ版と同様の塩基配列検索を自社内のコンピュータ上で実施することが出来ます。GGGenomeパッケージ版 創薬基本パックには、創薬研究に必要なヒト、マウス、ラットをはじめ創薬研究に必要な各種実験動物のゲノムや転写産物が幅広く含まれており、すぐに検索を実施することが可能です。

2022年版は、NCBI RefSeq、理研の公開する霊長類のオミックスデータベースD3G※2等の検索用データを更新し9種の生物種、42のデータベースを同梱し、特に要望の多かったD3Gラットのデータベースを追加し、そのほかの生物種のデータベースも最新のバージョンに更新いたしました。さらに検索機能を強化し利便性を向上させました。

検索機能については、これまで検索結果が2GBを超える大きなデータには対応できませんでしたが、2022年版よりその制限を緩和しました。また、検索結果画面から外部リンクに誤って接続し検索配列がネット環境に漏洩することを防ぐため、外部接続時にはダイアログを表示して注意喚起を行うよう改善いたしました。さらにRNA検索時にはGene SymbolとGene IDを別カラムに出力させるよう改善いたしました。

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■製品概要

製品名：GGGenomeパッケージ版 創薬基本パック2022年版
発売日：2022年6月13日
価格： 2,000,000円(税抜)
https://gggenome.retrieva.jp/